Фамилия Выскребенцев образована от прозвища Выскребенец, в основе которого лежит глагол «выскребывать» — «отделять, вынимать, чистить скребя, скобля». Такое прозвище мог получить человек, занимавшийся чисткой или обработкой чего-либо. Но что именно он мог выскребать? Судя по словообразовательной модели, это не просто случайное занятие, а, скорее всего, ремесло. В северных и центральных губерниях России «выскребенцами» иногда называли тех, кто выскабливал внутреннюю поверхность деревянной посуды или вычищал кожу после дубления. В более широком смысле прозвище могло закрепиться за человеком дотошным, скрупулезным, «выскребающим» всё дочиста.

Фамилия построена по стандартной модели: основа Выскребенец + патронимический суффикс -ев, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Выскребенца). Форма на -ев, а не на -ов, объясняется тем, что основа оканчивается на мягкий или шипящий согласный («ц»). В говорах фамилию могли произносить и как Выскребенцов, но в литературной норме закрепился вариант с -ев.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно, но можно предположить, что она сформировалась на территории северных и центральных уездов России, где бытовал сам глагол и его производные. В переписных книгах и ревизских сказках фамилия встречается нечасто, что говорит о её относительной редкости и локальном бытовании. Близкие по корню фамилии — Выскребов, Выскребышев — подтверждают, что основа была живой и продуктивной в прозвищной среде.

Таким образом, фамилия Выскребенцев — не просто отвлеченный «памятник славянской письменности», а конкретное указание на занятие или характер предка. Она сохранила в себе отзвук того ремесла или бытовой черты, которые когда-то выделили одного человека среди других.