Фамилия Вьюганова — женская форма мужской фамилии Вьюганов. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Вьюган, которое в древнерусской традиции давали человеку по сходству с природным явлением. Слово «вьюга» (метель, сильный ветер со снегом) в переносном смысле могло характеризовать человека беспокойного, стремительного, порывистого или, наоборот, холодного и сурового. В говорах «вьюга» также означала «суета, кутерьма», так что прозвище могло закрепиться за непоседой или тем, кто постоянно в движении.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ов- указывает на принадлежность («чей?»), то есть Вьюганов — сын или потомок Вьюгана. Форма Вьюганова, соответственно, означает «дочь или жена Вьюганова». Встречаются и однокоренные фамилии: Вьюгин, Вьюгов, Вьюженин, но Вьюганов — наиболее распространённая, поскольку суффикс -ан- придаёт основе уменьшительно-ласкательный или просторечный оттенок (ср. Иван — Иванушка, Вьюга — Вьюган).

Географически фамилия Вьюгановы не привязана к одной области — она встречается и в северных регионах (Архангельская, Вологодская области), где вьюги — обычное явление, и в центральной России. Это говорит о том, что прозвище было понятным повсеместно. Вероятнее всего, предок носителя фамилии получил прозвище не за профессию, а за характер или внешность — за стремительность, резкость или, может быть, за то, что его появление производило эффект «снежной бури».

Интересная деталь: в некоторых говорах слово «вьюган» имело и другое значение — «беспутный человек, гуляка». Если это так, то фамилия могла закрепиться за потомками человека с не самой лестной репутацией, но со временем утратила негативный оттенок, став просто родовым именем. Документальных свидетельств о дворянском происхождении Вьюгановых нет — фамилия, скорее всего, крестьянская или мещанская, что типично для прозвищ от явлений природы.