Скорее всего, фамилия Яконис образована от латышского слова jako – «зимняя длинная куртка, полупальто, кофта». Вероятно, она указывает на то, что основатель рода Яконис ходил в этой одежде. Согласно другой, менее правдоподобной версии, в основе этой фамилии лежит румынское слово jac – «грабеж».