Фамилия Ямушева — женская форма фамилии Ямушев. Её основа, скорее всего, связана с тюркским миром, а точнее — с чувашским или татарским языком. В основе лежит имя или прозвище Ямуш. В чувашском языке слово «ямуш» может означать «овраг», «яма» — такое прозвище могли дать человеку, живущему в низине или у оврага. Но есть и другая, более распространённая версия: Ямуш — это диалектная форма имени Ям (Ямиль) или производная от арабского имени Ямут, что значит «счастье», «удача». В таком случае фамилия образована по типичной для Поволжья модели: к основе на твёрдый согласный добавили русский суффикс -ев, а затем типовое окончание -а для женского рода.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: «Ямушева» буквально означает «жена или дочь Ямуша». Такая модель характерна для фамилий, возникших в среде крещёных татар и чувашей в XIX веке, когда при переходе в православие им давали русские патронимы. Фамилия встречается в Чувашии, Татарстане и соседних областях — это косвенно подтверждает её тюркские корни. В русском языке фамилия выглядит как обычная, но её основа явно не славянская, что делает её интересным примером межэтнического заимствования.

Споров вокруг этимологии почти нет: обе версии (географическое прозвище и личное имя) правдоподобны, но вторая — через имя Ямуш — встречается чаще в ономастических справочниках. Сословно предки Ямушевых, скорее всего, были государственными или ясачными крестьянами в Казанской или Симбирской губерниях, так как дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.