В основу фамилии легло мужское имя Яныга, которое, в свою очередь, является уменьшительной формой имени Ян, польского варианта крестильного мужского имени Иоанн (в переводе с древнееврейского – «милость Божия»). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Яныга, со временем получил фамилию Яныгин.