Фамилия Юганюк звучит как типичная украинская фамилия, и это первое, что бросается в глаза. Её выдает суффикс -юк, который в украинской ономастике указывает на «сына» или «потомка» (аналог русского -ов/-ев). В основе фамилии лежит личное имя Юган — народная, сокращенная форма от канонического имени Евгений. В украинском языке имя Евгений через стадию Евген дало форму Юген, а затем и Юган с характерным переходом «е» в «о» под ударением. Таким образом, Юганюк — буквально «сын Югана», то есть потомок человека по имени Юган (Евгений).

Однако есть и вторая, менее очевидная версия. В западных регионах Украины, особенно на Прикарпатье и Буковине, слово «юга» в местных говорах могло означать «ветер» или «теплый воздух». В этом случае прозвище Юган мог получить человек с ветреным характером, либо тот, кто жил на открытом, продуваемом месте. Но эта гипотеза слабее: прозвища от природных явлений встречаются реже, чем патронимы от имен, а суффикс -юк в первую очередь закреплен именно за отчествами.

Географически фамилия Юганюк распространена прежде всего в западной Украине — в Ивано-Франковской, Тернопольской и Львовской областях. В России или Беларуси она редка, что подтверждает её четкую региональную привязку. По социальному происхождению носители такой фамилии, скорее всего, относились к крестьянскому или казачьему сословию: в XVIII–XIX веках украинские фамилии на -юк массово закреплялись именно за сельским населением, в отличие от шляхетских фамилий на -ский.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Юганюк стоит в одном ряду с Югановым (русский вариант с суффиксом -ов), Юганенко (украинский вариант с суффиксом -енко, характерным для центральной и восточной Украины) и просто Юган. Каждый из этих вариантов рассказывает одну и ту же историю, но с разным диалектным акцентом: Юганюк — это именно западноукраинский след.