Фамилия Юсипина — редкий случай, когда отчество или прозвище было образовано не от полного крестильного имени, а от его просторечной, бытовой формы. В основе лежит имя Юсип — один из вариантов имени Иосиф. В русских говорах, особенно на юге и западе, звук «ф» часто заменялся на «п», а начальное «и» могло редуцироваться, так что церковное Иосиф превращалось в Осип, а в некоторых диалектах — в Юсип. Такая трансформация встречается в украинском и белорусском языках, где имя Иосиф звучит как Йосип, а в разговорной речи — как Юсип.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Юсипин, то есть сын, потомок Юсипа. Женская форма Юсипина — это, соответственно, жена или дочь Юсипина. Суффикс -ин в этой фамилии присоединён к основе, оканчивающейся на твёрдый согласный «п», что типично для фамилий от имён и прозвищ (ср. Гаврилин, Фомин).

С точки зрения географии, фамилия Юсипина наиболее вероятна в регионах, где были сильны украинские или белорусские диалектные влияния — например, в южнорусских областях (Курская, Воронежская, Ростовская области) или среди переселенцев на Урал и в Сибирь. В центральной России чаще встречается форма Осипов, а Юсипов/Юсипина — более редкий, локальный вариант.

Сословная принадлежность предков Юсипиных, скорее всего, была крестьянской или мещанской. Фамилии на -ин от просторечных форм имени (Юсип вместо Иосиф) обычно не встречались в дворянской среде, где предпочитали книжные или полные варианты. Так что носитель фамилии Юсипина может с большой вероятностью считать, что его предок был крестьянином или посадским человеком, которого в быту звали Юсипом, а не Осипом или Иосифом.

В ономастических справочниках эта фамилия не упоминается в числе частых, что говорит о её редкости. Если сравнивать с однокоренными — Юсипов, Юсипенко, Юсипчук — то форма Юсипина характерна именно для русской модели фамилии, а не для украинской или польской, где были бы суффиксы -енко или -ук.