Фамилия Заблотский звучит как типичная польская или западнорусская фамилия на -ский, но её корень — не польский, а вполне восточнославянский, хоть и с географическим оттенком. Основа здесь — слово «блот» или «блото», что в старых говорах означало «болото», «грязь», «топь». Приставка «за-» указывает на положение: «тот, кто живёт за болотом». То есть Заблотский — это человек «заблотный», то есть обитающий по ту сторону болотистой местности. Модель образования та же, что у фамилий Заозёрский, Зарецкий, Загорский: приставка + географический признак + суффикс принадлежности.

По типу суффикса -ский (а не -ов или -ин) фамилия указывает на шляхетское или, как минимум, на более позднее книжное происхождение. В Речи Посполитой такие фамилии часто получали дворяне, владевшие имением «Заблотье» или «Заблоты». В России фамилия могла возникнуть у выходцев из западных губерний — с территории современной Беларуси, Украины или Смоленщины, где слово «блото» было в ходу. В польском языке есть слово «błoto» (болото), и фамилия Заблоцкий (Zabłocki) там широко распространена. Русская форма Заблотский — это, скорее всего, русифицированный вариант польской фамилии, где «ц» перешло в «тс» под влиянием местного произношения.

Есть и менее вероятная, но возможная версия: связь с диалектным глаголом «блотать» — пачкать, марать. В этом случае прозвище Заблота могло относиться к неопрятному человеку. Но для фамилии на -ский, которая обычно указывает на место, а не на качество, первая версия убедительнее. Встречается также вариант написания через «о» — Заблотский, что подтверждает связь с «блотом», а не с «бладом» или иными корнями.

Сословно фамилия не обязательно дворянская. В XIX веке её могли получить и крестьяне, переселившиеся из деревни Заблотье, и мещане, записанные по месту жительства. В метрических книгах западных губерний Заблотские встречаются среди православных и униатов, реже — среди католиков. Географически фамилия тяготеет к Гродненской, Минской, Волынской губерниям, а также к югу Псковщины и западу Тверской области. Сейчас носители разбросаны по всей России и Украине, но концентрация остаётся на западе.