Фамилия Задойный — редкая и по звучанию, и по происхождению. Её основа сразу бросается в глаза: «задой» или «задойный». В современном русском языке это слово почти не употребляется, но в диалектах и в старом быту оно имело конкретное значение. «Задой» — период в жизни дойной коровы, когда она перестаёт давать молоко перед новым отёлом, то есть время «задоя», сухостоя. Соответственно, «задойный» — это либо относящийся к этому периоду, либо прозвище человека, который имел какое-то отношение к скоту в такую пору.

Скорее всего, прозвище Задойный давали крестьянину, который занимался скотоводством, — пастуху, дояру, или же просто человеку, за которым закрепилась эта бытовая характеристика. В русских говорах слово «задой» могло также означать «остаток молока после дойки» или «недой», но основной смысл остаётся хозяйственным, деревенским. Фамилия образована по модели прилагательного с суффиксом -н-, что типично для прозвищ, перешедших в фамилии без дополнительных родовых суффиксов (как, например, Чёрный, Мудрый, Грязный). В данном случае суффикс -ый указывает на мужской род, и фамилия закрепилась в форме именительного падежа.

Географически фамилия Задойный встречается крайне редко. Основные очаги — южнорусские области, особенно Ростовская область, Краснодарский край, а также Украина (в украинизированной форме Задойний). Это косвенно подтверждает связь с сельским хозяйством и скотоводством в степных регионах. Встречается она и у казаков, что логично: казачий быт был тесно связан с коневодством и разведением крупного рогатого скота.

В ономастических справочниках фамилия не описана широко, но по аналогии с однокоренными фамилиями (Задоев, Задоин, Дойников) можно уверенно говорить о её прозвищном происхождении. Никакой связи с «задоем» в значении «задняя часть» или «задний» здесь нет — это случайное созвучие. Человек с фамилией Задойный, скорее всего, потомок крестьянина или скотовода, получившего прозвище по примете, связанной с коровами и молоком.