Фамилия Загатина образована от прозвища Загата. В основе прозвища лежит слово «загат», которое в вологодских говорах означало «соломенную окуту избы на зиму», то есть утепление дома. В курских говорах «загатом» называли пустоту между плетнями, которую закладывали землей и соломой. Поэтому прозвище Загата мог получить хозяйственный человек, тщательно утеплявший жилье, либо плотник-строитель, занимавшийся такими работами.

По другой версии, прозвище связано с глаголом «загатить» — заваливать болото, застилать топкое место хворостом и засыпать землей. В этом случае Загатой называли человека, жившего в болотистой местности или на низменности, где долго не просыхала грязь.

Фамилия Загатина — женская форма, указывающая на принадлежность к роду Загатиных. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который в исходном значении отвечал на вопрос «чей?»: «дочь или жена Загаты». Это типичный пример так называемых «патронимических» фамилий, где основой стало личное прозвище, а не имя.

В мужском варианте фамилия звучит как Загатин. Оба варианта встречаются в разных регионах, но особенно часто — на севере и в центральной России, что подтверждает связь с вологодскими и курскими говорами.