Фамилия Захарато — редкий случай, когда греческое по происхождению имя попало в русскую фамилию не через стандартную модель на -ов или -ин, а через украинскую или южнорусскую огласовку. В основе лежит крестильное имя Захарий (от древнееврейского «Захария» — «вспомнил Господь»), но суффикс -ато указывает на иной путь образования, чем привычное отчество.

В русской ономастике суффикс -ато встречается в основном в фамилиях украинского и белорусского происхождения, часто с оттенком прозвищности или уменьшительности. Сравните: Головато, Носато. В случае Захарато модель могла быть такой: сначала от имени Захар образовали прозвище Захаратый — «тот, кто имеет отношение к Захару» или «сын Захара», а потом оно закрепилось как фамилия. Финальное -о типично для украинских фамилий на -ато (Захарато, а не Захаратов).

Географически фамилия тяготеет к юго-западу Российской империи: современные Украина, Беларусь, южные области России. В дореволюционных переписях Захарато встречается в Черниговской, Полтавской и Харьковской губерниях. Это не дворянская фамилия — скорее крестьянская или казацкая, фиксировавшаяся в ревизских сказках.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть от греческого корня «захаро» (сахар) с добавлением -ато, что дало бы значение «сладкий» или «сахарный». Но для этого нет убедительных исторических примеров, а связь с именем Захарий прослеживается чётко через однокоренные фамилии Захаров, Захаренко, Захаревич.

Таким образом, Захарато — это «сын Захара» в украинском звучании, фамилия, которая обошла стороной московскую модель на -ов и сохранила южную диалектную форму. Носители этой фамилии почти наверняка были выходцами из малороссийских земель, где имя Захарий было распространено среди православного населения.