Фамилия Залыгин — одна из тех, где корень на первый взгляд прозрачен, но при ближайшем рассмотрении даёт сразу несколько версий происхождения. Основа здесь — «залыг-», и главный вопрос в том, что она означала в народной речи.

Самый прямой путь — от слова «залыга», которое в русских говорах имело значение «лгун», «обманщик», «пустомеля». В этом случае фамилия образована по типичной модели от прозвища: человек получил кличку Залыга за несерьёзность или склонность к хвастовству, а его потомки стали Залыгиными. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Залыгин, то есть сын или человек из рода Залыги. Слово «залыга» родственно глаголу «залыгать» — начать врать, привирать. Подобные прозвища были распространены в крестьянской среде, где меткое слово часто закреплялось за человеком на всю жизнь.

Однако есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых диалектах «залыга» могло означать не обманщика, а человека, который «залыгает» — то есть задерживается, медлит, отлынивает от работы. В таком случае прозвище носило бытовой, а не моральный оттенок: не злонамеренный лжец, а просто ленивый или нерасторопный работник. Обе трактовки не противоречат друг другу, но первая — с прямым значением «лгун» — встречается в словарях и ономастической литературе чаще.

По модели образования фамилия Залыгин — типично русская, с патронимическим суффиксом -ин. Она стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Брехин (от «брехун»), Вралин (от «враль») или Заливин (от «заливала» — болтун, хвастун). Все они образованы от прозвищ, характеризующих речевое поведение человека. Географически фамилия Залыгин не привязана к какой-то одной области: она встречается и в центральных регионах России, и в Сибири, что говорит о её давнем бытовании среди разных групп крестьянства.

С точки зрения сословного происхождения, Залыгины — скорее всего, потомки крестьян или посадских людей. Дворянских родов с такой фамилией в исторических документах не зафиксировано, а значит, корни фамилии — в народной среде, где прозвища давали по характеру или поведению. Самый известный носитель фамилии — писатель Сергей Залыгин, что, впрочем, не меняет этимологии: его предки, вероятно, носили то самое прозвище несколько поколений назад.