Фамилия Замалдинова принадлежит к широко распространённому в тюркоязычных регионах типу фамилий на -ов/-ева, образованных от арабского имени Замалдин. Имя это составное: «Замал» (вариант «Джамал») означает «красота», «совершенство», а «дин» — «вера», «религия». Вместе имя переводится как «красота веры» или «совершенство религии». В арабской и тюркской традициях такие имена давали в надежде, что ребёнок будет украшением своей веры или станет образцом благочестия.

Фамилия Замалдинова — женская форма; мужской вариант — Замалдинов. По модели образования эта фамилия типична для татар, башкир, а также народов Кавказа, где фамилии на -ов/-ев активно формировали в XIX–XX веках из отчеств по отцу. Если предка звали Замалдин, его детей в официальных документах записывали как Замалдиновы — то есть «дети Замалдина». Суффикс -ов здесь не указывает на русское происхождение, а стал административным стандартом для многих народов Российской империи.

Встречаются и варианты написания — Замальдинова, с мягким знаком, что отражает разное произношение исходного имени в диалектах. В татарском языке имя Замалдин нередко произносят с твёрдым «л», поэтому мягкий знак в фамилии может быть результатом канцелярской ошибки или адаптации к русской орфографии.

Географически фамилия Замалдинова чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарской диаспоры в Средней Азии. В метрических книгах и ревизских сказках XVIII–XIX веков имя Замалдин фиксируется у крещёных татар и мусульман, что говорит о его бытовании в разных конфессиональных средах. Сословная принадлежность предков могла быть разной — от крестьян и торговцев до мулл, поскольку имя было распространено и среди духовенства.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Джамалдинов, Замалетдинов — показывает, что все они восходят к одному арабскому корню, но различаются в передаче первого слога через разные тюркские языки. Вариант Замалдинова — один из самых употребительных именно у татар, где звук «дж» в заимствованиях часто переходит в «з».