Фамилия Замару — редкий случай, когда географическая привязка оказывается важнее этимологии. Сразу бросается в глаза нетипичный для русской фамилии финал на -у. В исконно русских фамилиях такое окончание встречается в основном у фамилий украинского или белорусского происхождения (например, Замару, Паламару, Ковалю), где оно образовано от форм родительного или дательного падежа. Но есть и другая версия: фамилия могла возникнуть на русском Севере, где в диалектах сохранились архаичные окончания, или в среде, испытавшей влияние финно-угорских языков. Однако самый надёжный путь — искать корень в прозвище.

Основа «замар-» почти наверняка восходит к глаголу «замарать» — испачкать, сделать грязным. В старину прозвище Замара давали человеку неопрятному, неряшливому, либо тому, кто по роду занятий постоянно пачкался: печнику, сапожнику, кузнецу. Суффикс -у в таком случае — это либо остаток древней формы звательного падежа (как «отче» вместо «отец»), либо результат стяжения в живой речи. Встречаются и однокоренные фамилии: Замараев, Замарин, Замарай. Но Замару стоит особняком — она короче и архаичнее.

Если отбросить прозвищную версию, остаётся гипотеза о происхождении от имени-оберега. В дохристианской традиции ребёнку могли дать имя Замара, чтобы отвратить от него злые силы: мол, дитя такое грязное и никчёмное, что его никто не тронет. Эта практика известна у многих славянских народов. В таком случае фамилия Замару — прямое наследник этого имени, без промежуточного прозвища.

Точных данных о сословной принадлежности носителей фамилии нет, но по модели образования она скорее крестьянская или посадская, чем дворянская. Встречается фамилия преимущественно на западе и юге России, а также в Беларуси и на Украине. В современных базах данных Замару — фамилия малочисленная, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска: найти своих предков по такой редкой фамилии проще, чем по Ивановым.