Фамилия Заплишная — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную версию. Первое, что бросается в глаза: суффикс -н- и окончание -ая. Это типичная модель для фамилий, образованных от названий населённых пунктов (так называемые «географические» фамилии на -ский/-цкий, -ной/-ный). В русской ономастике фамилии с окончанием -ая чаще всего встречались на юге России, в Черноземье и на Кубани, где под влиянием украинской традиции закрепилась полная форма прилагательного женского рода.

Основа «Заплиш-» почти наверняка восходит к топониму — селу, хутору или урочищу с названием Заплишье, Заплишное или Заплишня. Такие названия можно встретить в исторических документах по Слобожанщине и южнорусским губерниям. Корень «плиш» — диалектный вариант слова «плешь» (лысина, открытое место). В народной географии «плешь» или «плишь» нередко обозначала безлесый участок, поляну среди леса, а приставка «за-» указывала на положение за этим местом. То есть Заплишье — это «селение за плешью», за лысой горой или вырубкой.

Менее вероятная, но возможная версия — прозвищная. Если отвлечься от топонима, «Заплишный» могло означать человека, живущего за «плишью» (за лысиной, за проплешиной на местности). Однако в таком случае фамилия была бы скорее Заплишнев или Заплишнов, а не Заплишная. Форма на -ая жёстко привязана к женскому роду прилагательного, что для прозвищ нехарактерно. Поэтому логичнее считать, что фамилия изначально принадлежала женщине (вдова, дочь) или, как чаще бывало, была закреплена за целым родом по названию места.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» описана модель, по которой фамилии на -ая возникали из притяжательных прилагательных от названий деревень. Если в документах XVII–XVIII века встречается запись «крестьянин из Заплишья», то его потомки могли получить фамилию Заплишские, а в просторечии — Заплишные. Со временем окончание -ые на юге переходило в -ая под влиянием местных говоров.

Таким образом, носитель фамилии Заплишная, скорее всего, происходит из рода, чьи предки жили в селе или хуторе, названном по безлесому участку за лесом или за горой. Точная локализация этого топонима сегодня не установлена, но регион поиска — южные области России, особенно Белгородская, Воронежская, Ростовская, а также восток Украины.