Фамилия Запорожин — одна из тех, где основа говорит о месте, а суффикс — о способе образования. В её основе лежит слово «запорожец» — житель Запорожья, исторической области в низовьях Днепра, известной Запорожской Сечью. Но здесь есть важная деталь: фамилия образована не напрямую от слова «запорожец» (тогда было бы Запорожцев или Запорожецкий), а от его усечённой или диалектной формы «запорожа» или «запорога». Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Запорожин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Запорожа.

Прозвище Запорожа могли дать казаку, который вернулся с Сечи, или человеку, который имел отношение к запорожскому войску — например, служил у них обозным, торговал с ними или просто носил характерную одежду и усы, как у запорожцев. В XVIII–XIX веках, после ликвидации Сечи, многие выходцы с Запорожья расселились по югу Российской империи — на Кубань, Дон, в Новороссию. Поэтому фамилия Запорожин чаще всего встречается в южных и центральных областях России, а также в восточных регионах Украины.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: основа «запорож-» (от «запорожец» с отсечением суффикса -ец) + притяжательный суффикс -ин. Это типично для фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я: так же сложились фамилии Горожин (от «горожа» — житель города), Сторожин (от «сторожа» — сторож). В украинской ономастике есть близкая фамилия Запорожец, а в польской — Zaporożec, но форма с суффиксом -ин — именно русская черта, характерная для севера и центра. В списках казачьих родов Кубани и Дона эта фамилия нередко фиксировалась, что подтверждает её связь с военно-служилым сословием.

Споров вокруг происхождения почти нет: географическая привязка надёжна. Единственная альтернативная версия — связь с глаголом «запорожить» (запереть, загородить), но она маловероятна, так как суффикс -ин в таком случае дал бы фамилию Запорогин, а не Запорожин. Так что носитель фамилии Запорожин, скорее всего, потомок человека, которого в своё время прозвали за связь с Запорожской Сечью — либо прямого казака, либо человека, жившего в тех краях.