Фамилия Запрягина — женская форма фамилии Запрягин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Запряга. В русской ономастике это слово связывают с глаголом «запрягать», то есть впрягать лошадь в телегу или плуг. Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, был возницей, кучером или крестьянином, чья работа требовала постоянного обращения с упряжью. В говорах слово «запряга» могло означать и сам процесс, и упряжь, и даже рабочую лошадь.

Модель образования типична для северных и центральных областей России: суффикс -ин указывает на принадлежность. Запрягин — буквально «сын Запряги» или «человек из семьи Запряги». Такие фамилии часто возникали в крестьянской среде, где прозвища давались по занятию или характерной черте. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще встречались на юге и востоке, -ин характерен для новгородских, псковских и владимирских земель.

Интересная деталь: в некоторых диалектах «запряга» имела переносное значение — упрямый, несговорчивый человек. Если прозвище дали за характер, то смысл фамилии меняется: не ремесло, а личное качество. Обе версии правдоподобны, но первая (профессиональная) встречается чаще — в русских фамилиях от названий занятий гораздо больше примеров, чем от черт характера.

Фамилия редкая, не относится к числу распространённых. Встречается в основном в центральных регионах России, единичные носители есть в Поволжье. Сословно — почти наверняка крестьянское происхождение: дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Письменные источники XVIII–XIX веков могли фиксировать её как Запрягинъ, что не меняет сути. В современном написании ударение падает на второй слог: Запря́гина.