Фамилия Зарубин образована от прозвища Заруба. Так нередко называли человека со шрамом, рубцом на лице. Веселовского упоминаются: Конон Алексеев Заруба, 1522 г., Москва; Терентий Зарубин, подьячий, 1638 г., Москва. Среди известных обладателей фамилии – Иван Никифорович Зарубин, известный как Чика (1736-1775), сподвижник Е. Пугачева, яицкий казак, руководитель восстания в Башкирии и осады Уфы и Елизавета Юльевна Зарубина (1900-1987), советская разведчица, которую сравнивают с легендарной Мата Хари. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Заруба, со временем получил фамилию Зарубин.