Фамилия Засыпайко образована от прозвища Засыпай (или Засыпайко), которое восходит к глаголу «засыпать». Это прозвище может относиться к профессиональным именованиям и указывать на род деятельности предка: прозвище Засыпай мог получить помощник мельника, работник, засыпающий зерно в ковш, а готовую муку — в мешки. Однако не исключено, что прозвище Засыпай (Засыпайко) может быть связано со словом «засыпать» в значении «погружаться в сон». Следовательно, так могли прозвать любителя поспать или вялого человека, который имел сонный вид. Веселовского упоминаются однокоренные именования: Засыпкин Конон (1646 год, Казань) и Засыпка Иван, крестьянин (1627 год). В случае, если прозвище предка звучало как Засыпай, суффикс -ко указывает на украинское происхождение фамилии Засыпайко. Так и прозвище Засыпай (Засыпайко) закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Засыпайко. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Засыпай (Засыпайко), со временем получил фамилию Засыпайко.