Фамилия Жаканова — женская форма, а мужской вариант — Жаканов. В её основе, скорее всего, лежит казахское личное имя Жакан, которое переводят как «близкий». Такая модель образования типична для тюркских фамилий: к имени предка добавляли русский патронимический суффикс -ов, чтобы адаптировать её в документах Российской империи. Значит, предок носителя фамилии, вероятно, был человеком, которого окружающие считали своим, «близким», или же так звали старшего в роду.

Менее распространённая версия отталкивается от прозвища, восходящего к многозначному казахскому слову «жак». У него несколько значений: «бок, сторона», «лицо, щека, челюсть», а также глаголы «мазать, смазывать», «нравиться», «быть полезным». Если прозвище дали по месту жительства — «живущий на краю, на боку селения», — то основатель рода Жакановых мог быть человеком, чей дом стоял на окраине. Другая возможность: прозвище отражало характер — «тот, кто нравится людям», или род занятий, связанный, например, со смазкой осей телег.

Есть и совсем редкая версия, связывающая фамилию с русским диалектным словом «жакан» — так называли свинцовую пулю особой конструкции для охоты из гладкоствольного ружья. В этом случае прозвище Жакан мог получить искусный охотник. Однако эта гипотеза менее правдоподобна, так как географически фамилия явно тяготеет к тюркоязычным регионам, а не к русским охотничьим артелям.

Точное место и время возникновения рода Жакановых можно установить только при глубоком генеалогическом поиске. Но уже сейчас ясно, что ядро фамилии — либо личное имя с положительной характеристикой, либо прозвище, описывающее внешнюю или социальную черту человека.