Фамилия Жанатаров — редкий случай для русской ономастики. Она образована не от славянского корня, а от казахского имени Жанатар. В переводе с казахского «жана» означает «новый», а «тар» — «узкий» или «тесный», но в составе личных имён это сочетание чаще трактуют как «новый свет» или «обновлённый». Имя могло даваться ребёнку как пожелание обновления рода, начала новой жизни.

Модель образования фамилии — типичная для тюркских фамилий, которые попали в русскую среду. Основа Жанатар- плюс русский патронимический суффикс -ов, который добавляли при оформлении документов в Российской империи. Это значит, что предок носителя фамилии звался Жанатар, а его потомки стали Жанатаровыми. Суффикс -ов здесь не указывает на принадлежность к русскому дворянству или крестьянству, а лишь фиксирует факт переписи: чиновник записал фамилию по отцу.

Географически фамилия привязана к Казахстану и приграничным регионам России — Оренбургской, Астраханской областям, а также к республикам Средней Азии. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: вероятно, родоначальник был известен в своём ауле или волости, но фамилия не разошлась широко.

С точки зрения социальной истории, Жанатаровы — это, скорее всего, потомки кочевников или полукочевников, которые получили фамилию в XIX — начале XX века при массовом учёте населения. В отличие от русских фамилий на -ов, которые часто образовывались от прозвищ или профессий, здесь основа — личное имя, что типично для тюркских народов.

Есть и альтернативная версия, хоть и менее вероятная: основа могла быть связана с арабским «жанат» (рай, сад) через персидское посредство. Но в казахском языке имя Жанатар устойчиво и имеет чёткую внутреннюю форму, поэтому версия с «новым светом» выглядит убедительнее.