Фамилия Жапарова — одна из тех, что напрямую связаны с тюркским именем Жаппар. В основе лежит арабский корень со значением «обладающий огромной силой», «могучий»; это один из эпитетов Аллаха. В мусульманской традиции такие имена давали, желая ребёнку силы и покровительства свыше. Фамилию образовали по обычной для тюркских народов модели: к имени отца (Жаппар) прибавили русский суффикс -ов, а к женской форме — -а. Мужской вариант — Жапаров.

Время появления фамилии точно не установить без генеалогического поиска. Формирование фамилий у разных тюркских народов шло неравномерно: где-то их закрепили в XIX веке при переписях, где-то — в советское время, когда паспорта стали обязательными. Поэтому носители фамилии могут быть как из Средней Азии (особенно Киргизии и Казахстана, где имя Жаппар встречается чаще), так и из татарской или башкирской среды.

Интересная деталь: в русском языке фамилия может писаться через «а» после «ж» — Жапарова, хотя в оригинале имя звучит как Жаппар. Это объясняется адаптацией: в русской записи двойные согласные нередко упрощаются. Встречаются и варианты с «о» на конце мужской формы — Жапаров, но исходное ударение в имени падает на второй слог: Жаппа́р.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Жаппара). Аналогично образованы фамилии Асанов, Ахметов, Рахимов. Если бы фамилия возникла в среде, где русские суффиксы не прижились, она могла бы остаться в форме Жаппаров или даже Жаппари — в зависимости от местных традиций.

О точном сословии предков говорить без архивных данных сложно. Имя Жаппар не было исключительно аристократическим или простонародным — его давали в разных слоях общества. Однако в ономастике известно, что фамилии на -ов в тюркской среде чаще фиксировали у оседлого населения, а не у кочевников, у которых долго сохранялась патронимическая система без закреплённой фамилии.