Фамилия Жаукенов — яркий пример казахской фамилии, адаптированной под русскую модель с помощью суффикса -ов. В основе лежит мужское имя Жаукен, которое образовано от казахского слова «жау» — враг, противник, недруг. Слово «жау» в тюркских языках имеет военную, часто эпическую окраску: так называли врагов в батальных сказаниях. Соответственно, Жаукен может переводиться как «побеждающий врагов», «враждующий» или «воинственный», то есть имя-пожелание мальчику стать сильным бойцом.

Суффикс -ов в данном случае — не исконный казахский элемент, а результат русификации в XIX — начале XX века, когда при записи в метрические книги или переписи населения к тюркским именам добавляли русские фамильные окончания. Таким образом, Жаукенов буквально означает «потомок Жаукена». В самой же казахской традиции фамилии образовывались иначе — через отчества (Жаукенұлы) или родовые имена, но под влиянием Российской империи форма на -ов стала стандартной.

Исторически носители фамилии происходят, скорее всего, из казахских родов Старшего или Среднего жуза, где имя Жаукен встречается чаще. Точная географическая привязка не документирована, но можно предполагать, что основатели рода жили в степных районах современного Казахстана, где традиционно ценились воинские качества. Сословно это были, вероятно, «черная кость» — свободные скотоводы, шаруа, а не аристократы-чингизиды, так как имена с корнем «жау» чаще давали простым воинам.

Несмотря на кажущуюся простоту, фамилия хранит отголосок кочевой военной культуры. В отличие от многих русских фамилий, образованных от профессий или внешности, Жаукенов прямо отсылает к эпохе, когда имя могло стать оберегом и программой на жизнь.