Фамилия Желнио — редкая и необычная для русского слуха, и её происхождение почти наверняка не связано с русской ономастической традицией. В русском языке нет ни корня «желн», ни суффикса «-ио», которые образовывали бы фамилии по модели «Желнио». Это почти стопроцентный маркер иноязычного происхождения.

Скорее всего, перед нами фамилия балтийского или западнославянского корня. Наиболее правдоподобная версия связывает её с литовским словом «želmuo» (побег, росток, отросток) или его диалектными формами. В литовском языке есть слово «žel̃ti» — расти, зеленеть. Фамилия могла означать «молодой побег», «отпрыск» или, в переносном смысле, молодого человека, юнца. Литовские фамилии нередко заканчиваются на -о, и при переходе в русскую среду окончание могло закрепиться как Желнио (или, в более русифицированном варианте, Желнев, Желнов).

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — польское или белорусское происхождение от слова «żółty» (жёлтый) через диалектные формы. Однако фонетически переход от «жёлтый» к «желн» проблематичен: проще было бы получить фамилию Жолтовский или Желтов. Версия с литовским «ростком» выглядит стройнее.

Никаких упоминаний фамилии Желнио в дворянских родословных книгах или у известных исторических деятелей нет. Это фамилия, скорее всего, крестьянская или мещанская, возникшая на западных окраинах Российской империи — в современной Литве, Беларуси или на пограничье с Польшей. Носители фамилии могли быть выходцами из литовских или белорусских деревень, где прозвище Желнио (Росток) давали либо высокому и худощавому человеку, либо младшему сыну в семье.

Таким образом, если вы ищете корни фамилии Желнио, наиболее вероятное направление поиска — литовская ономастика, а не русская. Фамилия могла быть записана в метрических книгах как Желнио, Жельнио или Желнев, и её исходное значение — «молодой побег», то есть прозвище, данное по внешности или возрасту.