Фамилия Желуницына — женская форма мужской фамилии Желуницын, а та, в свою очередь, образована от прозвища Желуница. В русском языке суффикс -ицын (-ицына) встречается реже, чем -ин или -ов, и указывает на принадлежность к человеку, чьё прозвище оканчивалось на -ица. То есть Желуницын — буквально «сын или потомок Желуницы».

Что могло означать само прозвище Желуница? Самая прямая версия — связь с желудём. В народе желудями называли не только плоды дуба, но и крепких, коренастых людей, иногда — упрямых или простоватых. Однако в русских говорах слово «желуница» имело и конкретное значение — так в некоторых областях называли дикую лесную грушу (мелкую, терпкую, похожую на жёлудь). Человек мог получить такое прозвище за внешнее сходство с плодом (невысокий, плотный) или за то, что собирал, торговал дичками.

Есть и другая, менее очевидная версия: «желуница» могло быть диалектным названием болезни или физического недостатка (например, желтухи или опухоли — от «желудок», «желудь» в значении «шишка»). Но эта гипотеза слабее, поскольку в документах и словарях такое значение не закреплено.

Географически фамилия Желуницын встречается преимущественно в центральных и северных областях России — в Вологодской, Костромской, Ярославской, а также на Урале. Это типичная крестьянская фамилия, образованная от прозвища, а не от имени или профессии. В списках дворянских родов она не значится.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Желудков, Желудев) показывает, что Желуницын стоит особняком: там основа — «желудок» или «жёлудь» напрямую, а здесь — уменьшительно-ласкательная или прозвищная форма с суффиксом -ица. Это говорит о том, что носитель прозвища был, скорее всего, заметной фигурой в своей среде — не просто «человек, похожий на жёлудь», а «Желуница», то есть прозвище с оттенком иронии или ласки.