Фамилия Жемчугин является самобытным памятником славянской культуры. Фамилия Жемчугин образована от прозвища Жемчуга. Оно ведет свое начало от нарицательного «жемчуг», значение которого В.И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет следующим образом: «самородные шарики, образующиеся в раковинах, причисляемые к драгоценным украшениям». Вероятно, прозвище Жемчуга относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог быть ювелиром или торговцем драгоценностями. Возможно также, что в основе фамилии Жемчугин лежит не прозвище, а мирское имя Жемчуга, связанное с символическим значением жемчуга. Издревле жемчуг считался олицетворением красоты, избранничества и целомудрия. Недаром ожерелье из жемчуга являлось одним из непременных украшений Венеры. Кроме того, в Древнем Риме он считался символом знатного происхождения. Веселовского записаны родственные именования: Жемчугин Иван, крестьянин (1564 г., Новгород), Прокофий Жемчужник, крестьянин (1495 г., Новгород), а также Иван Жемчужников, дворянин, пристав у черкасских князей (1584 г.). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Жемчуга, со временем получил фамилию Жемчугин. Безусловно, фамилия Жемчугин представляет собой замечательный памятник славянской культуры. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Жемчугин можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.