Фамилия Женисов — одна из тех, что ставят исследователя перед выбором: искать ли корень в антропонимике тюркских народов или в русской диалектной лексике. Оба пути ведут к разным, но одинаково логичным версиям.

Наиболее вероятное объяснение — происхождение от тюркского имени Женис (варианты: Женисбек, Женисхан). В казахском и других тюркских языках «женис» означает «победа», «победитель». Фамилии на -ов, образованные от таких имён, обычны у русских, в родословной которых были предки-тюрки, принявшие православие. В этом случае Женисов — «сын победителя», и фамилия могла закрепиться за казаком, крещёным татарином или башкиром, служившим в русских войсках.

Менее распространённая, но допустимая версия отсылает к русскому диалектному слову «женис» — так в некоторых говорах (например, на Севере) называли жениха или молодого мужа. Тогда фамилия — отчество от прозвища Женис, то есть «жених», «суженый». Так могли прозвать парня, который долго не женился, или, наоборот, того, кто женился рано и удачно.

Суффикс -ов указывает на русскую модель образования фамилий в XVI–XVIII веках. Если основа тюркская, то ударение, скорее всего, падает на первый слог: Же́нисов. Если от русского прозвища — возможен вариант Женисо́в.

Встречаемость фамилии невысока, она сосредоточена в основном в Оренбургской, Челябинской областях и в Казахстане, что косвенно подтверждает её тюркские корни. В дореволюционных переписях Женисовы могли записываться в казачье или крестьянское сословие, но точных данных о дворянском происхождении нет.

Таким образом, Женисов — фамилия с ясной и краткой этимологией, но с двумя разными историческими путями. Для носителя фамилии самый прямой способ узнать своё прошлое — обратиться к семейным преданиям и региону, откуда родом предки.