Фамилия Жинжина — женская форма, мужская — Жинжин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Жинжа. Что оно означало — вопрос, на который у исследователей нет единого ответа, но есть две рабочие версии.

Первая и самая очевидная: связь с диалектным глаголом «жинжать» или «жынжать». В южнорусских и украинских говорах это слово означает «визжать», «пищать», «издавать тонкий, неприятный звук». Прозвище Жинжа могли дать человеку с высоким, скрипучим голосом или тому, кто постоянно жаловался, ныл. Вторая версия менее распространённая, но не менее интересная: корень может восходить к тюркскому «жин» — «душа», «дух». В таком случае Жинжа — это прозвище задумчивого, мечтательного или, напротив, «бесноватого» человека. В русских фамилиях тюркские следы нередки, но для Жинжина такая этимология менее вероятна, поскольку фамилия почти не встречается в регионах активного татаро-русского контакта.

Суффикс -ин указывает на типичную восточнославянскую модель образования от основы на -а/-я: Жинжа → сын Жинжи → Жинжин. Фамилия редкая, её географический центр, судя по открытым данным, — Тамбовская и Липецкая области, отчасти Поволжье. Это косвенно подтверждает первую, «диалектную» версию: именно в этих краях слово «жинжать» было в ходу.

Социально фамилия, скорее всего, крестьянская. Дворянских родов Жинжиных в истории не зафиксировано, в родословных книгах она не значится. Носители, вероятно, были однодворцами или государственными крестьянами. Встречаются также единичные случаи написания через «е» — Женжин, что может указывать на местное «якающее» произношение, когда безударное «и» переходило в «е».