Фамилия Живогин, как и её близкий вариант Живагин, образована от личного прозвища. В основе лежит прозвище Живага, и здесь есть несколько возможных объяснений. Самая прямая версия ведёт к польскому слову dziwak — «чудак», «странный человек». Если принять эту гипотезу, основатель рода Живогиных был неординарной личностью, заметно отличавшейся от окружающих поведением или взглядами.

Есть и другая, менее очевидная версия, связанная с польским глаголом dźwigać. У него два значения: «нести с трудом, тащить» и «строить, возводить». В первом случае прозвище мог получить грузчик или просто очень сильный человек, во втором — строитель или архитектор. Какой из смыслов сработал в конкретной семье, теперь не установить.

Сама модель фамилии — с суффиксом -ин — указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Живаги». Такие фамилии в русском языке чаще всего возникали на северных и центральных территориях. О точном месте и времени появления фамилии Живогин сейчас говорить сложно: процесс закрепления фамилий шёл несколько столетий, и письменные источники по этой фамилии редки. Тем не менее, в ней отчётливо видна связь с польской лексикой, что может указывать на западнорусские земли или на влияние польской культуры в определённый исторический период.