Фамилия Жогинова — женская форма от Жогинов, и её разумнее разбирать через мужской вариант. Основа здесь — прозвище или нецерковное имя Жоган, Жог. В русских говорах «жог» означало либо пастуха, который подпаливал траву для нового выпаса, либо человека с жёстким, «жгучим» характером. Глагол «жечь» дал много прозвищ: Жог, Жоган, Жега — все они описывали либо занятие, либо свойство натуры.

Суффикс -ин- указывает на принадлежность: Жогинов — «сын Жогана» или «человек из семьи Жога». Это типичная модель для северных и центральных областей России, где -ин- так же част, как -ов-. Если бы фамилия звучала как Жогинов, её можно было бы спутать с притяжательным прилагательным от «жога» (пастух), но через «и» написание закрепилось, видимо, под влиянием акающих говоров, где безударное «о» произносится как «а», а на письме путаница дала вариант с «и».

Встречается фамилия в Поволжье и на Урале, где пастушеский промысел был распространён. В метрических книгах XIX века попадаются крестьяне Жогиновы из Вятской и Пермской губерний — это подтверждает связь с земледельческим и скотоводческим бытом. Вторая, менее вероятная версия, возводит корень к тюркскому «жог» (высокий, величественный), но для русской фамилии это натяжка: фамилия с таким корнем скорее встречалась бы у татар или башкир, а у Жогиновых она почти всегда записана как русская.

Таким образом, предки носителя фамилии с высокой вероятностью были пастухами или людьми с крутым нравом — «жгучими» в переносном смысле. Суффикс -ин- и география указывают на северорусское или уральское происхождение, а написание с буквой «и» в первом слоге — результат диалектного произношения, а не иной основы.