Фамилия Жогин происходит от прозвища Жога, которое имело совсем не одно значение. В разных русских говорах слово «жог» (или «жох») означало разное: в тульских — «край, кромка, ребро, грань», в тверских — «грубый мужик, мужлан», в архангельских — «старожил, коренной житель», а в калужских — «жулик, плут, воришка, карманник». Кроме того, в игре в бабки «жогом» называли кость, упавшую желобком вверх. Какое именно значение легло в основу прозвища конкретного человека, теперь не установить — это могла быть и характеристика внешности или поведения, и указание на давность проживания в месте, и игровой термин.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе прозвища Жога добавили суффикс принадлежности -ин. Суффикс этот указывает на то, что Жогины — потомки того самого человека по прозвищу Жога. Такая модель типична для фамилий, образованных от слов женского рода (Жога оканчивается на -а, поэтому и суффикс -ин, а не -ов).

Точное место и время возникновения фамилии Жогин назвать сложно — фамилии на Руси складывались на протяжении нескольких столетий, и документальные свидетельства по разным ветвям рода могут относиться к разным эпохам. Однако ясно, что исходное прозвище — живое, диалектное слово, а не книжное или церковное, что указывает на простонародное происхождение основателя фамилии. Интересно, что у фамилии есть однокоренные «родственники»: Жогов, Жоголев, Жоглов — все они восходят к тем же диалектным корням, но с разными суффиксами.