Фамилия Жубаныш — редкий пример тюркской фамилии, которая не прошла через русскую суффиксацию. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ев или -ин, Жубаныш сохранила исходную казахскую или киргизскую форму. Это прямо указывает на национальное происхождение носителя: фамилия распространена среди казахов и киргизов, реже встречается у башкир и татар.

В основе фамилии лежит мужское личное имя Жубаныш. В тюркских языках оно образовано от глагола со значением «утешать», «успокаивать», «жалеть». Соответственно, имя Жубаныш переводится как «Утешение» или «Отрада». Такие имена давали ребенку, которого ждали после потерь в семье, или в знак того, что он стал утешением для родителей. В казахском именослове есть и другие варианты того же корня — Жубат, Жубаныс, Жубания.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к глагольной основе добавили аффикс -ыш/-иш, который в тюркских языках образует имена действия или результата. Получилось имя со значением «тот, кто утешает» или «сам процесс утешения». Фамилия закрепилась по отчеству: предка звали Жубаныш, а его потомков стали называть по отцу — без дополнительных русских суффиксов, что характерно для фамилий, сложившихся в национальных регионах в советское время, когда паспорта записывали имя отца как фамилию.

С точки зрения социальной истории, фамилия не несет указания на сословие или ремесло. Она не дворянская, не купеческая, не крестьянская в русском понимании. Ее носители — потомки степных кочевников, скотоводов, у которых фамилии в современном виде появились только в XX веке. Поэтому искать в этой фамилии следы боярских родов или древних ремесленных прозвищ бессмысленно: она молодая и целиком восходит к личному имени.

Встречается написание Жубанышов — с русским суффиксом -ов, но это уже вторичная форма, возникшая при русификации документов. Исконный вариант без суффикса — верный маркер тюркского происхождения.