Фамилия Жукины образована от личного нецерковного имени Жук. В древнерусской традиции такие имена давали до крещения, и они часто отражали внешние черты или особенности поведения. Позднее имя закрепилось как прозвище: Жуком называли человека с очень темными, черными волосами — по ассоциации с цветом жука. Эта связь настолько очевидна, что другие версии происхождения фамилии кажутся менее убедительными. Иногда пытаются связать Жукиных с названием села Жукин в Киевской области, но это скорее совпадение: топоним сам, вероятно, произошел от того же личного имени, а не наоборот.

Письменные источники подтверждают, что имя Жук было распространено повсеместно. В документах XVI–XVII веков встречаются, например, Жук Левшин, сын Брюхатого (помещик в Сабельском погосте, 1500 год), Жук Прихожий (овруцкий крестьянин, 1545 год) или Прокоп Жук (мещанин, 1626 год). Эти записи показывают, что имя не было привязано к какому-то одному сословию — его носили и крестьяне, и мещане, и землевладельцы.

Фамилия Жукины образована по стандартной русской патронимической модели: к основе Жук- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — «Жукин сын»). Со временем форма множественного числа (Жукины) закрепилась за целым родом. Это одна из самых распространенных моделей в русских фамилиях, и здесь она работает без исключений: суффикс -ин присоединяется к основам на -а, -я или согласный, а Жук как раз заканчивается на твердый согласный.

Точное время и место возникновения фамилии назвать сложно — процесс формирования фамилий у разных слоев населения растянулся на несколько столетий. Однако ясно, что фамилия Жукины — это прямой след древнего мирского имени, которое в XV–XVII веках было обычным для славянского именослова.