Фамилия Жукин образована напрямую от имени или прозвища Жук. В древнерусской традиции это было нецерковное, мирское имя, которое давали в дополнение к крестильному. Со временем имя стало устойчивым прозвищем, и чаще всего так называли человека с очень темными, черными волосами — по аналогии с цветом насекомого.

Письменные источники фиксируют это имя повсеместно: в 1500 году упоминается Жук Левшин, сын Брюхатого, помещик в Сабельском погосте; в 1545 году — Жук Прихожий, овруцкий крестьянин; в 1626 — Прокоп Жук, мещанин. Эти записи показывают, что имя Жук было распространено в самых разных слоях населения — от землевладельцев до крестьян и горожан.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: к основе «Жук» добавился суффикс принадлежности -ин. В русской антропонимии суффикс -ин (как и -ов/-ев) указывал на то, что человек является чьим-то сыном, потомком или принадлежит к роду. Жукин буквально означает «сын Жука» или «человек из рода Жука». Это типичная «посессивная» фамилия, характерная для центральной России и севера.

Существует и менее вероятная, но географически конкретная версия: связь фамилии с названием села Жукин в Вышгородском районе Киевской области на Украине. В этом случае фамилия могла возникнуть от топонима — как указание на выходца из этого села. Однако такая версия остается гипотетической: топонимических фамилий с суффиксом -ин на русской почве меньше, чем личных, и при наличии широко распространенного имени Жук именно прозвищное происхождение выглядит убедительнее.

Таким образом, в основе фамилии Жукин лежит не прозвище по профессии или характеру, а внешний признак — цвет волос. Потомок человека, которого в старину прозвали Жуком за его черные волосы, со временем получил фамилию Жукин.