Фамилия Жусупбеков образована от мужского тюркского имени Жусупбек. Первая из них ведет свое начало от имени Жусуп, казахского варианта древнееврейско-арабского имени Юсуп – «получивший прибавку, дополнительные блага от Аллаха, дополнительно возвышенный Аллахом», «обладатель красоты, красавец». Вторая часть восходит к древнетюркскому «бек» - «князь, повелитель, начальник, руководитель, глава, хозяин, господин». Таким образом, потомок человека, которого звали Жусупбек, со временем получил фамилию Жусупбеков.