Фамилия Зикунова — женская форма мужской фамилии Зикунов, которая образовалась по стандартной для русского севера и центра модели: от прозвища или имени Зикун с добавлением притяжательного суффикса -ов. В основе лежит нецерковное имя или прозвище Зикун. Чтобы понять его происхождение, стоит заглянуть в диалектные словари. В северных и сибирских говорах «зикун» — это крикун, горлан, тот, кто зычно и громко говорит или поёт. Слово родственно глаголу «зикать» (кричать, звать) и звукоподражательному «зи» — резкому, пронзительному звуку. Таким образом, первого носителя прозвища могли выделить за голос: либо он был запевалой на гуляньях, либо базарным зазывалой, либо просто обладал несносной манерой говорить на повышенных тонах.

Есть и другая, менее распространённая версия, связывающая основу с тюркскими корнями. В некоторых тюркских языках «зик» или «зык» означает «часто», «много», а суффикс -ун мог указывать на деятеля. Но для русской фамилии это объяснение выглядит натянутым: прозвище Зикун встречается в документах XVII–XVIII веков именно в русских уездах (например, в переписных книгах Вятки и Перми Великой), где тюркское влияние было слабым. Поэтому версия с «крикуном» надёжнее.

Географически фамилия Зикунов (и, соответственно, Зикунова) исторически привязана к северо-востоку европейской России: Вологодская, Архангельская, Вятская губернии. Там слово «зикун» бытовало в живой речи дольше всего. В XIX веке носители фамилии числились преимущественно среди государственных крестьян и мещан — то есть предки не были дворянами или духовенством, а занимались земледелием, лесным промыслом или мелкой торговлей.

Интересная деталь: в старых документах фамилию могли записать через «ы» — Зыкунов. Это не ошибка, а отражение акающего произношения: в говорах «зыкун» и «зикун» звучали одинаково, а на письме путали буквы. Такая вариативность встречается в метрических книгах XIX века, и потомки одной семьи могли разойтись по разным написаниям — Зикуновы и Зыкуновы.