Фамилия Знаменьщиков — редкий случай, когда в основе лежит не просто профессия, а церковная должность, причём записанная в старом, «дореформенном» написании. Корень здесь — «знаменьщик», то есть человек, который пишет или держит знамя. Но в русской истории за этим словом закрепилось два совершенно разных занятия, и чтобы понять, какой из них дал фамилию, нужно разобраться в контексте.

Первое и самое очевидное значение — военное. Знаменщик (или знаменосец) нёс полковое знамя. Должность почётная и опасная: потеря знамени означала позор для полка, поэтому в знаменщики брали самых надёжных и рослых солдат. Однако фамилия образована не от «знаменщик», а от «знаменьщик» — с мягким знаком и суффиксом -щик-. Эта форма указывает на второе, церковное значение.

Второе значение связано с древнерусским церковным пением. Знаменьщиком называли певчего, который исполнял знаменный распев — одноголосную музыку, записывавшуюся особыми знаками, «знамёнами» (крюками). Такие певчие служили при храмах и монастырях, их искусство требовало многолетнего обучения. Фамилия Знаменьщиков, скорее всего, закрепилась за потомками именно церковного певчего, а не военного. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын знаменьщика».

Интересно, что фамилия сохранила архаичную форму слова. В современном русском языке «знаменщик» пишется без мягкого знака, а «знаменьщик» вышло из употребления вместе с самим знаменным распевом. Это делает фамилию не просто профессиональной, а ещё и лингвистическим маркером ушедшей эпохи — эпохи, когда церковная музыка была неотъемлемой частью быта, а певчие передавали своё мастерство из поколения в поколение. По сословной принадлежности носители фамилии, вероятно, относились к духовенству или к церковнослужителям, реже — к мещанам, если предок перешёл в светскую жизнь.