Фамилия Зызин — классический пример русской фамилии, образованной по модели «прозвище + суффикс -ин». Суффикс -ин, в отличие от -ов, присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я. В данном случае основа — прозвище Зызя. Это означает, что предок носителя фамилии был известен в своей округе как Зызя, а его дети и внуки стали Зызиными.

Прозвище Зызя имеет прозрачную этимологию. Оно восходит к диалектному слову «зыза», которое в русских говорах означало «косоглазие». Прямое значение — человек с дефектом зрения, который косит. Однако в переносном смысле, который подкрепляется украинским выражением «смотреть зизом» (бросать косые взгляды), прозвище могло закрепиться за человеком с недовольным, ворчливым характером. В народе косой взгляд часто ассоциировался с подозрительностью или недоброжелательностью, поэтому Зызей могли назвать не только кривого, но и угрюмого, вечно недовольного ворчуна.

Интересно, что модель с суффиксом -ин в этой фамилии указывает на её севернорусское или центральнорусское происхождение. В южных и западнорусских регионах предпочтение отдавали суффиксу -ов (теоретически возможная форма Зызов), но история закрепила именно вариант Зызин. Фамилия не относится к числу широко распространённых, но встречается в старых документах по Переславлю-Залесскому и Вологодской губернии, что косвенно подтверждает её северный след.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Зыков, Зырянов) показывает, что корень «зы» в русской антропонимии чаще связан с диалектной лексикой, а не с церковными именами. Зызин — редкий случай, когда в основе лежит конкретный физический недостаток, а не абстрактная характеристика. В словаре Б. Унбегауна русские фамилии на -ин от прозвищ с конечным -я описываются как типичные для крестьянской и посадской среды, что и было социальным контекстом для Зызиных: скорее всего, предки были крестьянами или ремесленниками, получившими фамилию по уличному прозвищу при переписях XVIII–XIX веков.