Фамилия Абаляева восходит к мужскому имени Абаляй, которое имеет сложную основу из нескольких компонентов. Первый из них — «аб» (вариант «абель») восходит к арабскому слову со значениями «отец ребенка», «основной, истинный владелец». Вторая часть — имя Гали (или Али), один из эпитетов Аллаха, означающий «великий, возвышенный, высший», «сильный, могущественный». Третий элемент — «ай» («яй») в древнетюркском языке означал «месяц». Таким образом, имя Абаляй можно перевести как «великий отец». Родители могли дать его ребенку в надежде, что тот станет главой большой крепкой семьи и его род не прервется.

Сама фамилия образовалась по стандартной русской модели: к основе Абаляй добавили суффикс принадлежности -ев. Такие суффиксы (-ов/-ев, -ин) свойственны не только русским, но и украинцам, белорусам, полякам. Потомок человека по имени Абаляй со временем получил фамилию Абаляев.

Интересно, что в отличие от многих фамилий на -ев, образованных от христианских имен, эта имеет мусульманские корни. Это говорит о смешанном этническом происхождении предков: вероятно, имя Абаляй бытовало в татаро-башкирской среде, а затем при переходе в русскую культуру к нему добавили славянский фамильный суффикс. Такие случаи — не редкость для Поволжья и Приуралья, где веками жили рядом разные народы.