Фамилия Абанин — одна из тех русских фамилий, чья основа уходит в тюркскую или арабскую языковую среду. В её центре лежит слово aba, которое в тюркских наречиях означает «отец», «почтенный старший» или «медведь». Именно это слово могло стать прозвищем родоначальника, а затем и основой фамилии.

Есть и версия, что фамилия связана с арабским именем Абан. Оно известно по мусульманской традиции и означает «ясный», «чистый». Если имя Абан носил предок, то при переходе в русскую среду оно естественным образом обрастало суффиксом -ин, образуя фамилию по модели «чей?» — Абанин, то есть «сын Абана».

Менее распространённое, но возможное объяснение — топонимическое. В Красноярском крае есть посёлок Абан, и фамилия могла возникнуть у выходца оттуда. Однако для фамилий на -ин такое происхождение встречается реже: обычно суффикс -ин указывает на принадлежность человеку, а не месту.

Формант -ин в фамилии Абанин — один из самых распространённых в русской ономастике. Он образует притяжательные фамилии от основ, оканчивающихся на -а, -я. По этой же схеме построены фамилии Пушкин, Гагарин, Бородин. В случае Абанина основа обрусела, но сохранила восточный корень.

Исторически фамилия могла закрепиться в среде служилых людей или дворянства, поскольку в XV–XVII веках многие выходцы из Золотой Орды, от печенегов и половцев, переходили на русскую службу и получали поместья. Их потомки нередко носили фамилии, образованные от тюркских прозвищ или имён. В этой среде фамилия Абанин и могла сформироваться.

Точных сведений о первом носителе фамилии нет, но её структура и семантика указывают на то, что предок Абаниных был человеком уважаемым — либо по возрасту, либо по положению. Фамилия звучит как напоминание о тех временах, когда русская культура впитывала элементы восточных традиций, перерабатывая их в новые, уже русские формы.