Фамилия Абанков принадлежит к распространённому типу русских фамилий на -ов. Эта модель образования проста: к основе, чаще всего имени или прозвищу, добавлялся суффикс принадлежности, отвечающий на вопрос «чей?». Абанков — значит «сын Абанка» или «человек из рода Абанка».

Самая очевидная версия происхождения основы — от имени Абан. Это краткая (уменьшительная) форма крестильного имени Абакум (церковное Аввакум). В древнерусском языке имя Аввакум, означающее по-древнееврейски «объятие» или «любовь Божья», часто сокращали в быту до Абан, Абаня. Суффикс -к- в форме Абанко (именно так звучала бы исходная фамилия в украинском или белорусском варианте) — типичный уменьшительный или обиходный. Таким образом, Абанков мог быть потомком человека, которого в семье звали Абаном или Абанькой.

Есть и вторая, менее очевидная, но возможная версия — прозвищная. В южнорусских говорах слово «абан» или «абанить» могло означать что-то, связанное с шумом, криком или упрямством. Сравните с диалектным глаголом «абанить» — громко кричать, ругаться. В этом случае Абанков — не от имени, а от прозвища Абан: шумливого, крикливого человека. Однако первая версия, от имени Аввакум, встречается в ономастике чаще и считается основной.

Фамилия редкая, её географическое распространение неоднородно. Чаще всего она встречается в центральных областях России и на юге, в зоне бытования акающих говоров (где «о» в безударном положении звучит как «а»). В письменных источниках XVIII–XIX веков фамилия могла фиксироваться как Абанковъ, а в редких случаях — с двойным написанием, если её путали с однокоренной фамилией Абакумов, образованной от полной формы имени.

Интересная деталь: фамилия Абанков стоит в ряду таких же «сокращённых» вариантов, как Абаков (от Абакум), Абашкин, Абашев. Все они ведут родословную от одного корня — имени Аввакум, но разошлись по разным ветвям из-за местных говоров и привычки сокращать длинные имена.