Фамилия Абанков построена по самой ходовой русской модели — с суффиксом -ов. Это суффикс принадлежности, он отвечает на вопрос «чей?»: Абанков буквально означает «сын Абанка» или «человек из рода Абанка». В основе лежит имя или прозвище Абанко (в белорусском или украинском произношении) — отсюда и форма на -ов, а не на -ин.

Самая надёжная версия происхождения основы — от имени Абан. Это обиходная, сокращённая форма крестильного имени Абакум (церковное Аввакум). В древнерусском языке длинное имя Аввакум, которое в переводе с древнееврейского означает «объятие» или «любовь Божья», в быту легко ужимали до Абан, Абаня. Суффикс -к- в форме Абанко — типичный уменьшительный, так что Абанков — это потомок человека, которого в семье звали Абаном или Абанькой.

Есть и вторая, менее очевидная версия — прозвищная. В южнорусских говорах слово «абан» или глагол «абанить» могло означать нечто связанное с шумом, криком или упрямством. Сравните с диалектным «абанить» — громко кричать, ругаться. Тогда Абанков — не от имени, а от прозвища Абан: шумливого, крикливого человека. Однако первая версия, от имени Аввакум, в ономастике встречается чаще и считается основной.

Фамилия редкая, её география неоднородна. Чаще всего она попадается в центральных областях России и на юге, в зоне акающих говоров (где безударное «о» звучит как «а»). В письменных источниках XVIII–XIX веков фамилию могли записывать как Абанковъ, а изредка путали с однокоренной Абакумов — от полной формы имени.

Интересная деталь: Абанков стоит в ряду таких же «сокращённых» вариантов, как Абаков, Абашкин, Абашев. Все они ведут родословную от одного корня — имени Аввакум, но разошлись по разным ветвям из-за местных говоров и привычки укорачивать длинные имена.