Фамилия Абдухановы образована от мужского имени Абдухан. Её основа составная: первая часть, «Абду», восходит к арабскому слову со значением «раб Божий» или «вечный, бесконечный». Вторая часть, «хан», — это тюркский и монгольский титул, обозначающий правителя, владыку. Таким образом, имя Абдухан буквально осмыслялось как «раб Божий, который как хан» или «вечный хан».

Корни фамилии уходят в XV–XVII века, в среду тюркских народов, связанных с Золотой Ордой, печенегами или половцами. Проникновение таких имён в русскую среду объясняется тем, что многие дворянские роды в России имели нерусское, восточное происхождение. Сведения в родословных о восточном корне фамилии Абдухановы обычно подтверждаются самим именем родоначальника.

Сама фамилия закрепилась по стандартной русской модели: к основе Абдухан добавился суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Абдуханов). Форма множественного числа (Абдухановы) в бытовом контексте обозначает род или семью в целом.

Фамилия представляет собой не просто генеалогический факт, а памятник восточной письменности и культуры, зафиксированный русской фамильной системой.