Фамилия Абдыков образована по классической для Российской империи модели: тюркское личное имя плюс русский патронимический суффикс -ов. В основе лежит имя Абдык — краткая или диалектная форма от Абдулла (араб. «раб Аллаха»). У казахов, киргизов, татар и башкир полное имя Абдулла в бытовой речи часто сокращалось до Абды, Абдык или Абдуш. Прибавление суффикса -ов, типичного для фамилий, оформленных в XIX–XX веках, дало буквальное значение «потомок Абдыка» или «сын Абдыка». Похожим образом появились Абдулов или Абдуллин, но суффикс -ов здесь указывает на более позднюю и полную русификацию, чем, например, -ин.

Менее вероятная версия связывает основу с тюркским словом «абдык», которое в некоторых диалектах могло означать «белый, светлый» — якобы так могли прозвать человека со светлыми волосами. Однако эта гипотеза не подкреплена серьёзными ономастическими источниками, и большинство исследователей сходится на именном происхождении.

Географически фамилия встречается в Казахстане, Киргизии, Татарстане и Башкортостане, а также в Астраханской и Оренбургской областях России. Распространённость невысокая, что говорит о локальном, родовом характере. Носители могли быть как крестьянами, так и казахами-кочевниками, получившими фамилию при переписях конца XIX века. В дореволюционных родословных книгах Абдыковы не значатся: дворянских корней у фамилии нет.