Фамилия Абубакарова образована от арабского мужского имени Абубакар, которое восходит к двум основам. Первая из них, «абу», является одной из форм слова «аб», в переводе на русский язык означающего «отец; истинный владелец». Вторая часть — имя Бакар (Бакир), которое имеет два значения: «обучающийся, изучающий; достигающий», «рано созревший, быстро выросший». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Абубакаровых можно лишь на основании генеалогических исследований.