Фамилия Абубякаров — один из тех случаев, когда по двум-трём буквам можно прочитать историю целого региона. Её основа — мужское имя Абубякар, вариант арабского Абу Бакр (أبو بكر — «отец девственницы»). Это имя носил первый праведный халиф, ближайший сподвижник пророка Мухаммада, поэтому у народов, исповедующих ислам, оно чрезвычайно распространено.

Ономастическая модель здесь классическая для русских фамилий, но с региональным оттенком. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей сын?» — «сын Абубякара». Конечное -ар в основе — характерный признак тюркской адаптации арабских имён. В отличие от более привычной татарской формы Абубакиров (с суффиксом -иров), вариант Абубякаров с гласной «я» и окончанием -ов выдает влияние русского письма. Звук [б'] передали через «бя», а не через «би». Такая запись типична для документальной фиксации фамилий у кумыков, ногайцев или кавказских тюрков в XIX — начале XX века.

Географически фамилия почти наверняка отсылает на Северный Кавказ, в первую очередь в Дагестан. Среди кумыков и даргинцев она встречается ощутимо чаще, чем в других регионах. Встречается и у чеченцев, но реже. Это не случайно: в дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках запись арабских имён через «я» вместо «и» была обычной практикой для русских писарей, работавших с местным населением. Именно они, записывая имя на слух, фиксировали живую речь, а не книжную норму.

Словообразовательно фамилия стоит в одном ряду с Абубакаровым, Абубакировым и Абубакаряном, но именно форма с «я» в корне и суффиксом -ов — самая редкая. Она сохранила след того, как имя звучало в живой речи: «Абубякар», а не книжное «Абубакир». Таким образом, Абубякаров — это не просто «сын Абубякара», а документ языкового контакта, где русский суффикс прирос к тюркскому произношению арабского имени.