Фамилия Абубов образована от мусульманского мужского имени Абуб – краткой формы имени Абубакер, которое в своей основе имеет два элемента: именной компонент «абу» и имя Бакер. Именной компонент «абу» - вариант компонента «абель», которое восходит к арабскому слову «аб», имеющему значения «отец ребенка; основной, истинный владелец». Имя Бакер в переводе с арабского означает «верблюжонок», «молодой, чистый, целомудренный». Имя Абубакер переводится на руский как «воплощение чистоты», «отец чисоты». Таким образом, потомок человека, которого звали Абуб, со временем получил фамилию Абубов.