Фамилия Агапонов образована от просторечной формы крестильного имени Агафон. В разговорной речи имя Агафон, пришедшее из греческого языка (где оно означало «добрый» или «благой»), часто звучало как Агапон — так называли в быту, а в документах записывали на слух. Поэтому фамилия Агапонов — это не отдельное имя, а фонетический вариант, закрепившийся в фамильной модели.

Имя Агафон носили несколько известных церковных деятелей: римский папа Агафон (678–682 годы), Иерусалимский патриарх Агафон (X век), а также двое мучеников, память которых приходится на 10 января и 14 февраля по юлианскому календарю. Такая популярность имени в святцах обеспечила ему широкое хождение на Руси, особенно в крестьянской и купеческой среде.

Суффикс -ов в фамилии Агапонов указывает на типичную восточнославянскую модель образования: от имени отца. Агапонов буквально значит «сын Агапона». Эта модель преобладала в центральных и южных регионах России, в то время как на севере чаще встречались фамилии на -их/-ых. Если ваш предок носил фамилию Агапонов, скорее всего, его семья происходила из территорий, где в XVI–XVII веках активно формировались родовые прозвания по отцу.

Интересно, что в некоторых говорах имя Агафон могло превращаться не только в Агапона, но и в Гапона — отсюда фамилия Гапонов, однокоренная Агапонову. Оба варианта восходят к одному источнику, но разошлись в произношении. Таким образом, Агапонов — одна из нескольких родственных фамилий, которые стоит рассматривать вместе, восстанавливая историю рода.