Фамилия Агашкины — характерный пример того, как народная речь преобразовывала церковные имена в бытовые прозвища, а затем и в фамилии. В основе лежит имя Агашка, которое было обиходной, разговорной формой крестильного имени Агафон. Само имя Агафон греческого происхождения и переводится как «добрый», «благой». Таким образом, далекий предок носителей этой фамилии, скорее всего, был назван при крещении Агафоном, а в повседневной жизни звался Агашкой.

Фамилия образована по стандартной для русской ономастики модели: к основе «Агашк-» добавили суффикс принадлежности «-ин». Этот суффикс указывает на то, что родоначальник был человеком из окружения или подчинения того, кого звали Агашкой. Буквально фамилия отвечала на вопрос «чей?» — «Агашкин сын» или «Агашкин работник». Со временем притяжательное прилагательное закрепилось как родовое прозвание.

Говорить о точном времени и месте возникновения фамилии Агашкины сложно. Процесс формирования русских фамилий был долгим, он растянулся на несколько столетий, с XV по XIX век. Однако можно предположить, что фамилия появилась в среде крестьян или посадских людей, где были особенно распространены уменьшительные формы канонических имен. Примечательно, что имя Агафон и его производные были более популярны в южных и центральных губерниях России, поэтому и корни фамилии, вероятно, стоит искать именно там.

С точки зрения словообразования, фамилия Агашкины стоит в ряду таких же «простых» фамилий, как Васькины, Петькины, Митькины. Все они возникли не от полного церковного имени, а от его бытового варианта, что говорит о демократичном происхождении носителей. В отличие от фамилий на «-ский», которые часто указывали на принадлежность к дворянству или духовенству, фамилии на «-ин» от кратких форм имен — это массовый пласт, отражающий живую народную речь.