Фамилия Аимбетова происходит от личного имени Аимбет, но его значение трактуют по-разному. По одной версии, имя Аимбет — вариант мусульманского имени Аймбет. Его основа «ай» в древнетюркском языке означала «месяц», а вторая часть — «мбет» — стяженная форма имени Мухаммет (Мухаммед). Имя пророка переводят как «восхваляемый», «достойный хвалы». Получается, что имя Аимбет могло означать «месяц Мухаммеда» или «лунный Мухаммед».

Другая версия связывает Аимбет с именем Хакимбек. В этом случае Аимбет — диалектальный вариант, где «ай» могло возникнуть как упрощение. Имя Хаким арабского происхождения, его значения — «умный», «образованный», «мудрец». Компонент «бек» восходит к тюркскому титулу «бег» — «властитель, господин». У народов Средней Азии беком называли землевладельца. Следовательно, Хакимбек переводится как «образованный бек» или «мудрый господин».

Обе версии возможны, но вторая кажется более правдоподобной с точки зрения словообразования: в тюркских языках много имен на «-бек» (например, Алимбек, Тулебек), и диалектное стяжение «Хакимбек» в «Аимбет» вполне естественно. Фамилию образовали по русской модели с суффиксом -ов/-ова: потомка человека по имени Аимбет стали называть Аимбетов, а для женщин — Аимбетова.

Фамилия редкая, ее географическая привязка — в первую очередь Казахстан и регионы Средней Азии, где тюркские и арабские имена смешивались веками. Носительница фамилии может с равной вероятностью вести род от человека, которого назвали в честь месяца и пророка, или от потомка местного бека, известного умом.