Фамилия Акелькин — одна из тех, что хранят в себе древнее личное имя, давно вышедшее из официального обихода. Её основа — Акелька, народная, обиходная форма канонического мужского имени Акила.

Имя Акила пришло на Русь вместе с христианством из латыни, где aquila означает «орёл» или «орлиный». В святцах это имя носит апостол от семидесяти Акила, уроженец Понта, живший в Коринфе. Он стал сподвижником апостола Павла, помогал ему в проповеди Евангелия и, по преданию, принял мученическую смерть. В народной среде полное церковное имя Акила быстро сократили и переделали на свой лад: в быту человека могли звать Акелькой — так же, как Ивана превращали в Иванку, а Павла в Павлушку.

По словообразовательной модели фамилия Акелькин — типичный пример «владельческого» суффикса -ин. В русской традиции этот суффикс присоединяли к основам, оканчивающимся на -а или -я, чтобы указать на принадлежность: Акелькин буквально значило «чей?» — «сын Акельки» или «человек из дома Акельки». Такая модель была особенно распространена в северных и центральных русских землях, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на юге.

Говорить о точной дате и месте возникновения фамилии Акелькин сложно: процесс закрепления наследственных прозваний в России растянулся на несколько столетий, с XV по XVII век. Однако само по себе сохранение редкой народной формы Акелька (а не, скажем, Акилов или Акильев) указывает на то, что фамилия могла сложиться в среде, где письменная фиксация имени была менее строгой, а устная традиция — сильнее. Это делает Акелькиных не просто носителями фамилии, а хранителями живого народного звучания древнего имени, которое когда-то означало «орёл».